MetaQTL MetaQTL представляет собой набор программ, предназначенных для анализа количественных признаков, полученных в карте сцепления. MetaQTL предлагает обобщенную структуру для тестирования и сопоставления QTL с использованием различных типов экспериментальных планов (обратное скрещивание, интеркросс и рекомбинантный инбредный) и призван помочь пользователю быстрее найти QTL с помощью соответствующего статистического теста. MetaQTL состоит из 3 основных программ: bmQTL, MetaQTL и MetaQTLX. MetaQTL, основная программа, выполняет требования пользователя. Его можно использовать для картирования QTL и метаанализа QTL. Программа изначально позволяет считывать данные QTL (генотип и эффект каждого QTL) из файла или задавать в качестве входного параметра. Используя эти данные, MetaQTL рассчитывает карту генетического сцепления и прогнозирует ее многоточечный показатель LOD. После этого он проводит интервальное картирование с несколькими моделями (доминирование, сверхдоминирование и кодоминирование) и несколькими критериями для выбора QTL со значительным эффектом. MetaQTL позволяет сохранять результаты анализа в виде файла XML для чтения с помощью второй программы, MetaQTLX. Это пользовательский интерфейс на основе XML, который позволяет пользователю выполнять метаанализ QTL из всех экспериментальных планов. Фактически, MetaQTLX считывает и анализирует XML-файлы, сгенерированные MetaQTL, для выполнения метаанализа. Результаты сохраняются в текстовом формате и могут быть проанализированы и визуализированы с помощью популярных программ визуализации текста, таких как Mendeley. Рассказ прошлой ночью. Повествование повествует об отношениях любви/ненависти между молодым мужчиной Анишинабеком и его девушкой в долине реки Верхняя Мадаваска. Это рассказано с обеих точек зрения, как если бы они переживали одно и то же, но каждый по-своему. История Пикока «Это часть жизни» была вдохновлена тем, как коренные народы реагируют на вызов токсичных свалок. «Я думаю, что это универсальная тема», — сказал Пикок. «Что любовь и ненависть могут сосуществовать, потому что это часть жизни, и ты столкнешься со всяким дерьмом в жизни. Твоя любовь -------------------------------------------------- --- MetaQTL написан на чистой Java и может обрабатывать все данные QTL, экспериментальные проекты и карты связей с использованием объектно-ориентированного программирование. Он интуитивно понятен в использовании и имеет широкий спектр опций. Он будет управлять всеми экспериментальными деталями а также все известные источники стохастических ошибок, включая картографические и фенотипические ошибки. MetaQTL (Meta-analysis QTL) представляет собой набор из трех программ: MetaQTL, MetaQTL2 и MetaQTL3. Они могут обрабатывать наборы Данные о местоположении/значении QTL для любого заданного (количественного) признака. Программы могут реконструировать карту с аллелями и рекомбинациями по хромосомам, определить (взвешенную) генетическую карту эксперимента, связать положение и признаки, провести метаанализ заданных наборов данных QTL из разных исследований, а также провести метаанализ набора данных, полученных из разных фенотипы. Метаанализ наборов данных QTL, а также различных фенотипов QTL позволяет идентифицировать локусы, которые общие для данного фенотипа, локусы, проявляющие количественные плейотропные эффекты, локусы, оказывающие влияние в зависимости от генетического фон и локусы, которые влияют на разные признаки в разных генетических фонах. Программы написаны на чистой Java и не требуют никакого другого внешнего программного обеспечения, такого как Microsoft Excel или другие электронные таблицы. Для анализа набора данных QTL и создания карты требуется минимальное взаимодействие с пользователем. Главное меню приводит к наборам данных, которые можно проанализировать, а затем к результатам. Для просмотра данных и карт можно щелкнуть соответствующую ссылку в верхнюю строку меню. Результаты отображаются в виде таблиц и карт, которые очень легко читаются. Их также можно экспортировать в текстовый файл, который включает происхождение QTL и может быть открыт в любом текстовом редакторе. MetaQTL2 — это программный пакет, который может (опционально) обрабатывать наборы данных о местоположении/значении нескольких QTL. Наборы данных должны быть предоставлены в текстовых файлах (разделенных табуляцией или запятой) с заголовками столбцов (идентификатор QTL, Позиция в QTL, название признака) и количество наборов данных. Набор данных состоит из маркеров с их положением и ценности (аллели). Маркеры могут быть указаны как «отсутствующие» или «присутствующие», и предполагается, что последние соответствуют недостающие значения. Генетические карты с маркерами и их положением fb6ded4ff2
Related links: